يُعد قسم المختبرات الطبية أحد الأقسام الأساسية في كلية التقنية الطبية، ويُعنى بإعداد كوادر فنية مؤهلة تمتلك المعرفة العلمية والمهارات العملية اللازمة للعمل في المختبرات الطبية والتشخيصية. يهدف القسم إلى تخريج مختصين قادرين على إجراء الفحوصات والتحاليل المخبرية المختلفة بدقة وكفاءة، والمساهمة في تشخيص الأمراض ومتابعة الحالة الصحية للمرضى.